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摻雜類的精修,之前所寫的“同構(gòu)不同化學(xué)組分精修”給出過一些操作及分析。這類精修是粉末衍射精修中出現(xiàn)頻率很高的情形,摻雜和固溶有諸多相似之處,二者很多情形下是一致的。有很多老師、同學(xué)建議可以針對該類精修多寫一些推文,因此,就摻雜類的精修寫一系列操作范例,這里做一個更詳細(xì)的推文。摻雜類也可以認(rèn)為是固溶體類。按照X射線結(jié)構(gòu)分析的結(jié)果,主要分為以下三種:替代式摻雜、填隙式摻雜和缺位式摻雜[1,2]。便于理解,我們使用固溶體及簡單的示意圖進(jìn)行說明(圖1)。
- 替換固溶體(Substitutional):由溶質(zhì)原子代替溶劑晶格中的原子構(gòu)成,如Cu溶于Ni中而成的固溶體。
- 填隙固溶體(Interstitial):由溶質(zhì)原子溶于溶劑晶格中原子之間的而形成的間隙中構(gòu)成,如C溶解于Fe中而成的固溶體。
- 缺位固溶體(Vacancy):由溶質(zhì)原子替代溶劑晶格中原子并形成的缺位構(gòu)成,如TiC中溶入金屬鈦時,則在碳化鈦晶格中出現(xiàn)應(yīng)為碳原子占據(jù)但未占據(jù)的空位而構(gòu)成缺位固溶體。
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圖1 三種摻雜情況示意圖
我們這里的摻雜精修均以第一種情況,即:替代式摻雜來說明。后續(xù)兩種摻雜,如果哪位同學(xué)可以提供數(shù)據(jù)也可以推出相應(yīng)推文,這里我們先就替代式(固溶)摻雜做一個簡單了解。
替代式(固溶)摻雜有以下一些特點(diǎn):
- 替代前后,晶胞中的原子(離子)數(shù)目不變。可以是一個元素替代另一個元素,或者是一個元素替換化合物中的某個元素。就化合物而言,一般摻雜元素與被替換元素的離子大小差別越小,可以摻雜的量就越大。在精修中,如果A元素替代B元素,則有Occ(A)+ Occ (B-A) = Occ (B).
- 替代與被替代原子的位置一致。在精修中,需要保持原子坐標(biāo)一致。
- 固溶體中,晶胞參數(shù)隨(替換)摻雜含量的變化呈線性關(guān)系,即:符合Vegard定律。因此,晶胞參數(shù)的變化規(guī)律也可以用來判斷摻雜過程中是否有相變情況發(fā)生。同時,該規(guī)律還可以無損進(jìn)行摻雜組分測定。例如:在Y3Al5O12 (YAG):Nd激光晶體中,晶胞參數(shù)隨Nd含量的線性關(guān)系可以獲得,隨后根據(jù)該線性關(guān)系,通過測試晶胞參數(shù),可在不損壞晶體的條件下,測得YAG:Nd中Nd的含量。
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圖2 Y3(1-x)Nd3xAl5O12晶胞參數(shù)隨組分變化關(guān)系[1]
數(shù) 據(jù):Y2Mg3Ge3O12 + MgO 混相,定性結(jié)果見圖3;數(shù) 據(jù) 角度:2theta 10 – 120° ;定 性 軟件:Jade,數(shù)據(jù)庫為PDF-2004.![]()
圖3 數(shù)據(jù)定性結(jié)果
Y2Mg3Ge3O12在ICSD中已經(jīng)有發(fā)表的結(jié)構(gòu),這里我們?yōu)榱酥v解替換精修,使用Y3Al5O12(YAG)的結(jié)構(gòu)來獲得Y2Mg3Ge3O12的結(jié)構(gòu),同時進(jìn)行兩相精修操作。YAG為石榴石結(jié)構(gòu),是一種經(jīng)典的結(jié)構(gòu),關(guān)于它的研究論文有很多,報道的結(jié)構(gòu)文件也有多個。在ICSD數(shù)據(jù)庫中檢索YAG的結(jié)構(gòu),檢索結(jié)果如下,帶有☆的為高質(zhì)量數(shù)據(jù),我們下載code為74607的CIF文件,至于為什么下載這個文件,純粹只是因?yàn)樵撐募?994年發(fā)表而已。![]()
圖4 ICSD數(shù)據(jù)庫中YAG結(jié)構(gòu)檢索結(jié)果
下面詳細(xì)講解如何依據(jù)YAG晶體結(jié)構(gòu)獲得進(jìn)行該數(shù)據(jù)精修。
Y3Al5O12,空間群為Ia-3d,屬于立方晶系,a = b = c。其晶胞參數(shù)空間群信息如下表:表1 YAG晶胞參數(shù)及空間群信息
cell_length_a | 12.0241(5) ? |
cell_length_b | 12.0241(5) ? |
cell_length_c | 12.0241(5) ? |
cell_angle_alpha | 90 |
cell_angle_beta | 90 |
cell_angle_gamma | 90 |
cell_volume | 1738.43 ?3 |
cell_formula_units_Z | 8 |
space_group | Ia-3d |
space_group_IT_number | 230 |
其中,Y有一個晶體學(xué)格位,記為Y1,Wyckoff位置為24c;Al有兩個晶體學(xué)格位,記為Al1,Al2,Al1 Wyckoff位置為16a, Al2 Wyckoff位置為24d 。整體結(jié)構(gòu)如下,Y1為八配位的12面體(圖中綠色多面體),Al1為六配位的八面體,Al2為四配位的六面體(分別為淺藍(lán)色和橙色多面體)。具體配位及離子半徑如表所示。![]()
圖5 Y3Al5O12在a軸方向的晶體結(jié)構(gòu)圖。紅色為O原子,綠色為Y原子,淺藍(lán)色為Al1,橙色為Al2。配位多面體顏色同原子顏色。
表2 不同配位數(shù)下中心陽離子的離子半徑
Ion | Coord. | Ionic R. (?) |
Y+3 | 8 | 1.019 |
Mg+2 | 6 | 0.72 |
Mg+2 | 8 | 0.89 |
Ge+4 | 4 | 0.39 |
Ge+4 | 6 | 0.53 |
Al+3 | 4 | 0.39 |
Al+3 | 6 | 0.535 |
由離子半徑以及電價平衡關(guān)系,Y2Mg3Ge3O12可由Y3Al5O12進(jìn)行以下替換獲得:- (Y3++Al3+) 替換為(Mg2++Ge4+),此時得到的化學(xué)式為:Y2MgGeAl4O12;
- 4Al3+ 替換為 2(Mg2++ Ge4+),此時得到的化學(xué)式為:Y2Mg3Ge3O12.
因此,初步推斷,Ge4+占據(jù)Al3+位置,Mg2+既占據(jù)Y3+位置,也占據(jù)Al3+位置,依據(jù)離子半徑大小關(guān)系,偏向于占據(jù)6配位的Al1。
01、晶胞參數(shù)修正。由于是大半徑離子Mg2+替代小半徑原子Al3+量更多,Y2Mg3Ge3O12的晶胞參數(shù)必定大于Y3Al5O12的晶胞參數(shù)。我們使用該YAG的cif進(jìn)行Lebail擬合時,初始差別很大,擬合圖如下:![]()
圖6 Le Bail擬合初步結(jié)果。以Ia-3d,a = 12.0241 ?為初始條件
放大觀察,黑色計算線與紅色測試數(shù)據(jù)峰位差別較大,原因就是替換量較多導(dǎo)致的晶胞參數(shù)與初始模式差別較大,這時候可以手動修改加大晶胞參數(shù),由12.0241 ?修改為12.2241 ?。隨后運(yùn)行,出現(xiàn)如下擬合結(jié)果:
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圖7 Le Bail擬合初步結(jié)果。以Ia-3d,a = 12.2241 ?為擬合條件
02、在此基礎(chǔ)上,繼續(xù)按照“Fullprof精修參數(shù)及順序”所寫的Zero,Cell Para. a,Bac.,U等圖形參數(shù)精修后,可得到初步結(jié)果如下。![]()
圖8 Le Bail擬合初步結(jié)果。經(jīng)過Zero,Cell Para. a,Bac.,U等圖形參數(shù)精修后的截圖
03、修正峰型不對稱性型。在PCR文件中,找到“AsyLim”關(guān)鍵字,將底下對應(yīng)的數(shù)值由0修改為50,保存后修正不對稱性。該數(shù)值代表修正2theta在初始角度至該角度范圍內(nèi)的峰型不對稱。
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圖9 Le Bail擬合初步結(jié)果。經(jīng)過不對稱性修正后的擬合結(jié)果
步驟三 添加原子進(jìn)行Rietveld精修
01、依據(jù)替代摻雜的特點(diǎn)及占位分析結(jié)果,添加替代原子。替代原子坐標(biāo)與占據(jù)格位坐標(biāo)一致,占有率之和與原占有率保持一致。結(jié)構(gòu)占有率由化學(xué)占有率推算所得。占有率計算見Fullprof兩相精修處理。pcr文件中,修改如下:![]()
圖10 使用YAG的cif轉(zhuǎn)換得到的pcr文件原子部分截圖![]()
圖11 依據(jù)YAG結(jié)構(gòu)修改后的pcr文件原子部分截圖
這里需要重點(diǎn)講解一下設(shè)置:
A、3個Y中有1個Y被1個Mg替代,此時3*Y1 = 2*Y1 + 1*Mg1;表現(xiàn)在坐標(biāo)和占有率上則為:x(Mg1) = x (Y1),y(Mg1) = y (Y1),z(Mg1) = z (Y1);occ (Mg1)+occ (Y1) = 0.25, occ (Mg1) = 1/2 *occ(Y1);B、剩下的2個Mg替換Al1。由于YAG中Al1只有2個,因此這2個Mg就全替換Al1。PCR中應(yīng)將Al1的位置全部修改為Mg,如下:Al1 Al 0.00000 0.00000 0.00000 0.00000 0.16667 0 0 2 0Mg2 Mg 0.00000 0.00000 0.00000 0.00000 0.16667 0 0 2 0C、3個Ge全部替換Al2。YAG中Al2有3個,因此正好全部替換。PCR中將Al2的位置全部修改為Ge,如下:Al2 Al 0.37500 0.00000 0.25000 0.00000 0.25000 0 0 2 0Ge2 Ge 0.37500 0.00000 0.25000 0.00000 0.25000 0 0 2 0將原子類型數(shù)由4修改為5,保存即可得到目標(biāo)PCR文件。![]()
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圖11 使用修改后的pcr文件,勾選scale后精修截圖
03、保存,再勾選O原子坐標(biāo)精修。
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圖12 使用修改后的pcr文件,勾選scale和O原子坐標(biāo)后精修截圖
04、隨后依次逐項(xiàng)添加精修參數(shù)(Bac. , Cell, U, W, X, Scale),勾選后精修結(jié)果如下:![]()
圖13 逐項(xiàng)添加精修參數(shù),并最后一起修正后精修截圖
05、該結(jié)構(gòu)中溫度因子默認(rèn)為各向同性溫度因子,且均為B = 1.2 ?2。修改為0,然后再選擇各向異性熱振動因子U,對該系列參數(shù)進(jìn)行精修。![]()
圖14 修正原子熱振動參數(shù)U后精修截圖
步驟四 添加第二相進(jìn)行Rietveld精修
第二相為空間群為Fm-3m的MgO。先單獨(dú)對第二相精修,精修順序同上,最后將兩相的參數(shù)均勾選進(jìn)行精修即可。注意兩相共同的精修參數(shù),比如,Zero,Bac.。最終精修結(jié)果如下:
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圖15 最終精修截圖
Rp: 6.60 Rwp: 9.54 Rexp: 6.66 Chi2: 2.05Ratio Rp/Exp=cRp/cExp: 1.57Weighted Average Bragg R-factor: 3.30Weighted Average RF-factor: 3.74兩相含量為:Fract_Y2Mg3Ge3O12(%): 94.52( 0.30); Fract_MgO(%): 5.48( 0.11)![]()
勾選界面“Output”中的“Out CIF”選項(xiàng)框,如下紅色框,即可得到Y(jié)2Mg3Ge3O12的cif文件,同時也可以得到精修后MgO的cif文件。Fullprof有很多很多數(shù)據(jù)輸出格式,譬如,hkl,vesta,fou可以直接用于作圖或計算,后期針對Fullprof的out作一個說明。
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圖16 Fullprof out界面截圖
最后給出精修后二者的CIF對比,如下:
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小編學(xué)識有限,不當(dāng)之處請批評指正。
[1] 梁敬魁. 粉末衍射法測定晶體結(jié)構(gòu)[M]. 科學(xué)出版社, 2011.
[2] 維基百科. 固溶體。
https://bk.tw.lvfukeji.com/wiki/%E5%9B%BA%E6%BA%B6%E4%BD%93
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技術(shù)咨詢服務(wù)包括:北京高??萍假Y源對接、危險廢棄物梳理、環(huán)境影響評價、環(huán)保項(xiàng)目竣工驗(yàn)收、場地環(huán)境調(diào)查等多個領(lǐng)域。開展的分析測試服務(wù)包括:X射線衍射分析、土壤礦物檢測、水質(zhì)檢測、場地環(huán)境檢測、二噁英檢測、建材VOC檢測、固廢檢測、理化參數(shù)等檢測項(xiàng)目,已取得CMA檢驗(yàn)檢測機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定和ISO/IEC 17025檢測實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可資質(zhì)。科學(xué)儀器研發(fā)方面:具備國內(nèi)領(lǐng)先的 X 射線衍射 / 熒光分析儀器的研發(fā)生產(chǎn)能力,在 X 射線分析儀器的開發(fā)領(lǐng)域擁有多項(xiàng)自主知識產(chǎn)權(quán)。單位先后通過北京市級企業(yè)科技研究開發(fā)機(jī)構(gòu)、高新技術(shù)企業(yè)、中關(guān)村高新技術(shù)企業(yè)等認(rèn)證。 若您有任何咨詢問題,可聯(lián)系我們,我們會為您解答。400-0064-028 、010-62423361
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