同構(gòu)不同化學(xué)組分精修
發(fā)布時間:2021-03-12 來源:北達(dá)燕園微構(gòu)分析測試中心
關(guān)注我們 獲取更多精彩內(nèi)容
01 簡要概述
從元素周期表到個人的日常習(xí)慣,至更大的物質(zhì)世界,都充斥著數(shù)學(xué)之美。種種的智能算法,都是基于數(shù)據(jù)庫的學(xué)習(xí)與自我推翻。目前已經(jīng)有較為完善的晶體學(xué)數(shù)據(jù)庫,ICSD (Inorganic Crystal Structure Database) 是最大最完善的無機晶體學(xué)數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫所提供CIF數(shù)據(jù)包含化合物結(jié)構(gòu)信息。然而,處在處處是坑的世界中,并不是所有合成的化合物都能找到對應(yīng)的結(jié)構(gòu)文件。
02
ICSD數(shù)據(jù)庫中已有Lu3Al5O12結(jié)構(gòu),檢索結(jié)果如下,帶有☆的為高質(zhì)量數(shù)據(jù),我們下載編號為23846的CIF文件。
圖1 ICSD數(shù)據(jù)庫中Lu3Al5O12檢索結(jié)果
Lu3Al5O12,空間群為Ia-3d,屬于立方晶系,a=b=c。其中,Lu有一個晶體學(xué)格位,記為Lu1;Al有兩個晶體學(xué)格位,記為Al1,Al2。整體結(jié)構(gòu)如下,Lu1為八配位的12面體(圖中綠色多面體),Al1為四配位的四面體,Al2為六配位的八面體(分別為橙色和淺藍(lán)色多面體)。具體配位及離子半徑如表所示:
圖2 Lu3Al5O12在c軸方向的晶體結(jié)構(gòu)圖。紅色為O原子,綠色為Lu原子,橙色為Al1,淺藍(lán)色為Al2。配位多面體顏色與原子顏色一致。
表1 相關(guān)離子不同配位數(shù)的離子半徑
由離子半徑以及電價平衡關(guān)系,可以得出,Lu2CaAl4SiO12可以通過Lu3Al5O12,將(Ca+Si)取代(Lu+Al)即可得到。因此,初步推斷,Ca占據(jù)Lu1格位,Si占據(jù)Al格位,至于是Al1還是Al2目前尚不能進(jìn)行判斷。
詳細(xì)步驟見推文XRD精修的那些事兒(4)。經(jīng)過Zero,Cell Para. a,Bac.,U等圖形參數(shù)精修后,初步結(jié)果如下。
圖3 Le Bail擬合初步結(jié)果。以Ia-3d,a = 11.906為初始條件
2.3 添加Ca原子進(jìn)行Rietveld精修
a、替代原子與占據(jù)格位坐標(biāo)一致,占有率由化學(xué)占有率推算所得。占有率計算見XRD精修的那些事兒(7)。pcr文件中,修改如下:
b、保存,勾選Scale以及O原子坐標(biāo)精修。
圖4 部分Lu替換為Ca后的Rietveld精修圖
2.4 添加Si原子進(jìn)行Rietveld精修
如前所述,Lu3Al5O12中Al有兩個晶體學(xué)格位,Al1,Al2。那Si到底應(yīng)該占據(jù)哪個格位,或者都占據(jù)呢?在元素周期表中,Al和Si是緊挨著的(原子序數(shù)為13,14),原子序數(shù)相差很小,就X射線而言,二者原子散射因子相差很小。因此,從X射線衍射數(shù)據(jù)來判斷Si在Al哪個格位,不是很容易。我們不妨可以嘗試Al隨機占據(jù)Si格位,來看精修結(jié)果。
圖5 (上)Al,Si在元素周期表中的位置;(下)X射線對不同原子序數(shù)(1 - 90)原子的散射因子
2.5 Si占據(jù)Al1格位
Lu3Al5O12按照結(jié)構(gòu)占有可寫為:Lu2(AlI3AlII2)O12。依次再進(jìn)行格位占有率計算。
圖6 Si占據(jù)Al1格位后的Rietveld精修圖
查看sum里面的精修結(jié)果,除了加了一個原子,結(jié)果無變化。
2.6 Si占據(jù)Al2格位
圖7 Si占據(jù)Al2格位后的Rietveld精修圖
查看sum里面的精修結(jié)果,除了加了一個原子,結(jié)果無變化。由此可見,在處理Al,Si占位上XRD是比較懵的,原因已經(jīng)提及。既然如此,那該怎么考慮這個占位呢?除去中子衍射還可以做一些其余測試如固態(tài)核磁等來區(qū)分Si的配位環(huán)境,畢竟兩種配位環(huán)境差別較大,一個是四面體一個是八面體。
03 其余說明
如圖8上所示,黑線為模擬的Lu3Al5O12的衍射圖譜,紅線Lu2CaAl4SiO12為實驗測試數(shù)據(jù)。一眼看去,似乎沒啥區(qū)別,在此我們二者疊加為圖8下所示:(黑色為Lu3Al5O12,紅色為Lu2CaAl4SiO12)
圖8 (上)模擬的Lu3Al5O12的衍射圖譜與實驗測試圖譜;(下)圖譜疊加
對比可以看出:差別最明顯的是18.21°左右的(211)晶面以及35.60°左右的(420)晶面的衍射強度。將兩個晶面在結(jié)構(gòu)圖中標(biāo)出,如圖9所示。紫色為(211)晶面,綠色為(420)晶面,兩個晶面均穿過Al原子,同時緊鄰Lu原子,考慮到Al和Si原子散射因子接近,因此,我們可以得出結(jié)論:在這兩個晶面上的衍射強度的變化主要受Lu格位的影響。(Lu格位有替換)
圖9 Lu3Al5O12中(211)與(420)晶面
04 輸出最終精修結(jié)果
感謝北京科技大學(xué)材料學(xué)院明同學(xué)提供的原始數(shù)據(jù)。
免責(zé)聲明:資料來源網(wǎng)絡(luò),以傳播知識、有益學(xué)習(xí)和研究為宗旨,所提供內(nèi)容僅供讀者參考交流,科學(xué)研究使用,其他用途不得轉(zhuǎn)載或下載。如涉及侵權(quán),請聯(lián)系我們及時刪除。
13611330937